Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms