Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO2Q7Z6W1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms