Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBE3BQ7Z3V4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE3BQ7Z3V4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE3BQ7Z3V4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms