Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HS2ST1Q7LGA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS2ST1Q7LGA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms