Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCTD1Q719H9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCTD1Q719H9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCTD1Q719H9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCTD1Q719H9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms