Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms