Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms