Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C15orf39Q6ZRI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C15orf39Q6ZRI6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C15orf39Q6ZRI6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C15orf39Q6ZRI6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms