Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF111Q6ZNA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF111Q6ZNA4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms