Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSMFQ6X4W1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.1 ms