Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf89Q6UWU4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf89Q6UWU4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf89Q6UWU4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms