Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO3Q6UWJ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms