Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms