Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms