Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM4Q6P4Q7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms