Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTRHD1Q6GMV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms