Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARMIL2Q6F5E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms