Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS3Q68E01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
INTS3Q68E01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms