Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNS3Q68CZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TNS3Q68CZ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNS3Q68CZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNS3Q68CZ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms