Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRCH2Q5VUJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH2Q5VUJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH2Q5VUJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms