Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MYOM3Q5VTT5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYOM3Q5VTT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
MYOM3Q5VTT5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MYOM3Q5VTT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MYOM3Q5VTT5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms