Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE2Q5VT97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms