Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRTP1Q5TC63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms