Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF14Q5SWL7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF14Q5SWL7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms