Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAP1Q5SW96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms