Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM240Q5SV17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms