Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01556Q5JQF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms