Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AKAP4Q5JQC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AKAP4Q5JQC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
AKAP4Q5JQC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AKAP4Q5JQC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AKAP4Q5JQC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AKAP4Q5JQC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AKAP4Q5JQC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AKAP4Q5JQC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms