Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN4Q5BKX8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN4Q5BKX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms