Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KHDC3LQ587J8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms