Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKDCCQ504Y2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKDCCQ504Y2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKDCCQ504Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms