Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC1Q4ZHG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms