Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO43Q4G163 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO43Q4G163 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms