Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms