Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF3Q496Y0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF3Q496Y0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms