Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms