Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRFIP1Q32MZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms