Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HFEQ30201 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HFEQ30201 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HFEQ30201 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HFEQ30201 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HFEQ30201 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HFEQ30201 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HFEQ30201 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HFEQ30201 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HFEQ30201 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HFEQ30201 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HFEQ30201 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms