Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC27Q2M243 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC27Q2M243 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms