Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTL8BQ17RB0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL8BQ17RB0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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