Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDO1Q16878 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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