Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPPQ16740 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPPQ16740 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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