Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF239Q16600 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF239Q16600 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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