Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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