Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIV2LQ15477 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIV2LQ15477 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms