Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC23AQ15436 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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