Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNN3Q15417 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNN3Q15417 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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