Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC41Q15345 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LRRC41Q15345 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms