Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SNX17Q15036 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX17Q15036 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms