Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAPTM4AQ15012 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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